Pe 19 ianuarie 2015, Curtea de Apel Chișinău l-a condamnat pe fostul ministru la 4 ani de închisoare cu executare. Decizia privind arestul fostului ministru nu a fost luată de către judecători în ziua pronunțării condamnării și se presupune că acesta ar fi părăsit Republica Moldova, prin regiunea transnistreană. El a fost dat în căutare națională.
 
Gheorghe Papuc a fost găsit vinovat de neglijență în serviciu în cazul protestelor de masă din 7 aprilie 2009, soldată cu decesul unei persoane, Valeriu Boboc. Împreună cu Papuc, și fostul comisar general de poliție, Vladimir Botnari, a fost condamnat la 2 ani de închisoare, dar cu suspendare.

Procesul contra lui Botnari și Papuc a început în iunie 2010. La sfârșitul lui 2011, Judecătoria sectorului Centru iî achitase pe cei doi generali.