Conform hotărârii, Agenția are misiunea de a dezvolta și asigura implementarea politicii statului în sfera științei militare, cercetării științifice pe segmentul securității și apărării, memoriei și istoriei militare, precum și de a asigura respectarea regimului mormintelor și operelor comemorative de război. Agenția își va realiza funcțiile stabilite de un Regulament, în următoarele domenii de activitate: știința militară, cercetarea științifică pe segmentul securității și apărării naționale și al istoriei militare; memoria militară, promovarea valorilor și tradițiilor istorice naționale și internaționale;  controlul de stat asupra regimului mormintelor și operelor comemorative de război, transmite sursa citată.

Hotărârea Guvernului a stabilit efectivul-limită al Agenției pentru Știință și Memorie Militară, în număr de 75 de unități, cu un fond anual de retribuire a muncii conform legislației.

Potrivit documentului, Agenția va avea următoarea structură: conducerea; Direcția studii strategice de apărare și istorie militară (Secția studii strategice de apărare și securitate, Secția istorie și artă militară); Direcția muzeologie și memorie militară (Muzeu militar, cu statut de secție); Serviciul muzeografie; Complexul memorial „Capul de Pod Șerpeni” (cu statut de serviciu); Serviciul patrimoniu (Secția memorie militară); Serviciul acorduri internaționale; Serviciul ceremoniale militare; Direcția management operațional (Secția financiar-administrativă, Secția logistică, Serviciul comunicare și managementul documentelor, Serviciul juridic și resurse umane).

Agenția va fi condusă de director, numit în funcție publică și eliberat sau destituit din funcție publică, în condițiile legii, de către ministrul Apărării. În activitatea sa, directorul Agenției este asistat de doi directori adjuncți, numiți în funcție și eliberați din funcție, în condițiile legii, de către ministrul Apărării, la propunerea directorului Agenției.